Сучасна класифікація мікроорганізмів та її еволюція

Загальновизнаною та найбільш поширеною є класифікація бактерій Д. Берджі. Згідно з визначником, виданим у 1993 р., бактерії поділяють за будовою клітинної стінки та забарвленням за Грамом на такі відділи: Gracilicutes — тонкошкірі (грамнегативні); Firmicutes — товстошкірі (грампози-тивні), Tenericutes — не мають клітинної стінки (мікоплазми), Mendisicutes — архебактерії (вони непатогенні). Метод фарбування за Грамом ґрунтується на будові пептидоглікану муреїну. Запропонував Грав в 1884 році. Цей метод має надзвичайно важливе діагностичне значення, тому що Грам+ і Грамбактерії (Г+, Г-), вони особливо по різному реагують на фактори середовища. Сутність методу полягає в тому, що барвники трифенілметанового ряду в комплексі з йодом затримуються клітинними стінками Г+ бактерій.

Гбактерії не забарвлюються цими барвниками і залишаються безбарвними. Одна з перших спроб розробки наукової класифікації бактерій належить датському вченому О. Ф. Мюллеру (1773). Він поділив усі відомі на той час види бактерій на два роди — Monas i Vibrio. Подальше вивчення бактерій викликало необхідність побудови філогенетичної системи, яка б розкривала споріднені відношення між різними групами бактерій з урахуванням їхнього еволюційного роз­витку.

За визначником бактерій Бергі усі прокаріоти поділено на групи, які не мають таксономічного статусу.

Група 1. Спірохети (Spirochaeta). Включає порядок (Spiro-chaetales). Це одноклітинні спіральнозвивисті бактерії завдовжки від З до 500 мкм.

Група 2. Аеробні рухомі спіралеподібні або зігнуті грамне-гативні бактерії. Бактерії цієї групи вкриті міцною оболонкою, ру­хаються за допомогою полярно розташованих джгутиків.

Група 3. Нерухомі аеробні грамнегативні зігнуті бактерії.

Групу представляє родина Spiromonaceae, яка об'єднує сім родів. Представники цієї групи мають тороїдну форму (у вигляді замкнених і незамкнених кілець), а деякі — спіральну і дугоподібну форми.

Група 4. Аеробні грамнегативні палички і коки. У групі об'єднано вісім родин: Pseudomonadaceae, Rhizobiaceae, Azotobac-teriaceae, Methyllococcaceae, Acetobacteriaceae, Halobacteriaceae, Lehionellaceae i Neisseriaceae.

Група 5. Факультативно-анаеробні грамнегативні палички.

У цій групі об'єднано три родини: Enterobacteriaceae, Pasteurillaceae i Vibrionaceae. До першої родини належать рухливі і нерухомі, неспо­роносні палички, серед яких трапляються сапрофіти і паразити. Хе-моорганогетеротрофи. Деякі види мають здатність утворювати кап­сули. Бактерії цієї родини поширені майже скрізь: в ґрунтах, прісних і солоних водах, на рештках рослинних і тваринних організмів, у ки­шечнику багатьох видів тварин тощо. мікроорганізм бактеріальний біополімер хімічний Група 6. Анаеробні грамнегативні прямі, зігнуті або спі­ральні палички. Родина Bacteroidaceae є основною таксономічною одиницею цієї групи. Прокаріоти, які належать до цієї родини, є по­ліморфними, неспороносними облігатними анаеробами хемоорга-нотрофами.

Група 7. Сірковідновлюючі або сульфатредукуючі бактерії.

До групи належать різноманітні за формою еубактерії. Вони є грам-негативними облігатними анаеробами хемолітотрофами; мають здат­ність відновлювати в анаеробних умовах сірку або сульфати до H2S, використовуючи для цього молекулярний водень і сульфати як кін­цевий акцептор електронів у процесі засвоєння ацетату, лактату, пропіонату, етанолу та інших речовин.

Група 8. Анаеробні грамнегативні коки. До групи віднесено тільки одну родину Veillonellaceae, представники якої мають вигляд моно-, диплоі стрептококів, а також скупчень.

Група 9. Рикетсії і хламідії. Група об'єднує два порядки — Rickettsiales i Chlamydiales. Рикетсії — облігатні внутрішньоклітинні паразити членистоногих: вошей, бліх і кліщів. Вони мають кулясту, паличкоподібну, бацилярну і міцелярну форми.

Група 10. Мікоплазми. Бактерії цієї групи виокремлені у від­діл Tenericutes, клас Mollicutes, порядок Mycoplasmatales. До них на­лежать найменші серед відомих нині клітинних організмів.

Група 11. Ендосимбіонти. Прокаріоти цієї групи ще дуже ма­ло вивчені. Ендосимбіонти пристосовані до життя в клітинах хазяїна.

Група 12. Грампозитивні коки. Група об'єднує родини: Micrococcaceae, Deinococcaceae i Peptococcaceae та 15 родів, пред­ставники яких відрізняються між собою як філогенетичне, так і фенотипічно та ін.